但就在中研院與台大幫捉對撕殺過程中，台大醫學院的動向最受矚目，關鍵原因在於，此次台大校長遴選首度加入「獲得校務會議代表3分之1以上才能成為推薦候選人」，而醫學院占了校務會議代表3分之1強人數，只要醫學院支持誰，誰就能進入第2輪競賽。
但不管如何，預計12月底召開的台大臨時校務會議，醫學院都將成為兵家必爭之地，只要得到近30票醫學院力挺，就可輕易跨過門檻進入第2輪，在1月5日召開的遴選委員會中對決。
本刊調查，上一屆選舉楊泮池第一輪就以11票比10票，一票之差險勝前雲科大校長楊永斌，而且恰好過半直接勝出，因此這次的遴選規則中明訂，必須先選出2名高得票者，再選出過半委員支持的人選為校長當選人，換言之，明年1月5日勢必得進行2輪投票。
就有台大內部人士擔心，遴選委員會21席中，台大人僅占9席，就算團結也無法過半，加上這次中研院參選者實力堅強，未來2個月將是關鍵期。這次的遴選委員中，學校、行政、社會公正人士以及校友總會代表都是經過民主程序推選，唯獨教育部代表的3席是由教育部長指定，目前這3席分別是教育部次長姚立德、前教育部長鄭瑞城以及中研院院士鄭淑珍，這3票屬意誰還有待觀察。
此外，中研院院長廖俊智以社會公正人士代表入選，卻有2位中研院副院長是候選人，當天投票將是一大變數。中研院回應表示，有關台大校長遴選案，無法評論，但無論結果為何，未來會與台灣大學及其他學術單位繼續合作，一同為台灣的學術研究貢獻心力。
