台灣漫畫基地一樓為漫畫主題商店，二、三樓由策展團隊自行策展，也可做為漫畫家發表及展覽的空間，四樓是漫畫創作者的家，提供進駐空間與創作設備。
賴有賢表示，之前在總統府跟蔡英文總統見面時，蔡總統就跟他表達支持台灣原創漫畫的心意，台灣漫畫基地也代表政府對台灣漫畫的重視。他認為，漫畫基地是台灣面向世界的一個窗口，「我一直把漫畫基地定位成台灣的漫畫大腦，不管是制定政策或規劃內容，以及跟全世界的漫畫家合作也好，它會扮演一個很關鍵的角色。」
另外他也強調，台灣漫畫家可以把漫畫基地當作一個家的概念，「以前大家可能在不同縣市、不同的工作室創作，如果說我們現在有一個很好的聚集地，以前是祕密基地，現在可以在檯面上，大家一起來探討怎樣讓漫畫更精進，怎樣讓故事更好。」在政府支持下，他也期望藉由漫畫基地的成立，可以讓更多的台灣漫畫家勇敢地說出「我是漫畫家」。
阮光民則表示，漫畫基地對台灣漫畫的意義可能大於對漫畫家的意義，「以前台灣漫畫有點像浮萍漂來漂去，現在至少有一個根的感覺。」他認為，未來想做漫畫的人，至少知道有一個地方可以去，國際來的漫畫家或觀光客，也可以知道哪裡看的到台灣漫畫，至少有一個聚焦的地方。
