此外，首府大學聘任前教育部長吳清基、東方設計大學董事長李福登為董事，也遭質疑是為了協助爭取補助款的門神。
本刊調查，首府大學的前身是由王宮田、黃秀孟經營的致遠管理學院，少子化後經營出現困難，由現任董事長應秀鳳的丈夫蔡清淵將其買下，將其更名為台灣首府大學。蔡清淵靠遊走兩岸致富，相關企業有蓮潭國際會館、高雄國際會館、金典書局企業有限公司 、台泳企業股份有限公司（台南水都）、晶采國際股份有限公司、南運鐵路承攬運輸、香港銀河出版有限公司、湖南宏夢銀河傳媒有限公司，事業版圖龐大。蔡清淵病逝後，由其妻應秀鳳接任學校和所有企業董事長。
私校並非私人企業，是具有公益性質的非營利教育機構，但私校家族化問題所在多有，如今連國立大學都出現拉幫結派、循私舞弊等爭議，如何防止學校高層利用職權謀取個人或家族利益，使爆出問題的大學回到正軌，是主管機關無可迴避的責任。
對聘任前教育部長吳清基擔任無給職董事的動機遭質疑，首府大學指出，吳前部長已退休多年，是前董事長蔡清淵的舊識，給予學校很多建議、支持，讓學校走在正軌上，讓學校能在少子化的浪潮中屹立不搖，質疑吳前部長運用影響力當私校門神太不厚道，完全是惡意指控。
