2004年3月19日，競選總統連任的陳水扁與副總統呂秀蓮在台南掃街拜票卻遭遇槍擊事件，兩人的腹部、膝蓋分別受傷，隨後，時任總統府秘書長的邱義仁在總統府舉行記者會證實彈殼「在總統的身上」，而被記者問及「總統既然中彈，他是步行進醫院的嗎？」邱義仁當時掛著一抹微笑回答：「呵呵，可能嗎？」 卻成為經典，後續藍營更把這一抹微笑形容是「詭異的微笑」，質疑背後是綠營自導自演。
不只藍營，2007年3月，呂秀蓮接受廣播電台專訪也曾說，當時邱義仁開記者會「神祕兮兮」，惹出這麼多的麻煩，「他真的要跟民進黨、總統道歉」。但對於這抹微笑，邱義仁事後曾受訪解釋，因為當時記者會氣氛很悶、壓力很大，會這樣笑，只是因為「不想把氣氛弄得那麼悶吧」。
69歲的邱義仁，現任民進黨智庫、新境界文教基金會副董事長兼執行長，以及台灣日本關係協會會長，過去歷任包括總統府、國安會、行政院、民進黨四大秘書長，也曾擔任行政院副院長，在黨內素有「第一軍師」頭銜，這次大選，則再度主掌小英政策兵符。
