空軍司令部指出，經専案小組嚴謹調查，並由運安會及美方協助執行黑盒子資料下載、解讀資料，黑盒子無實質損壞，飛行全程主警告未觸發，發動機動力輸出與飛行員操作同步，機械故障可能性低。依現有事證初判，當時山區天氣驟變，雲霧濃厚，又受移動雲層影響，飛行中瞬間進雲，飛行員不及爬高應變，觸地墜毀，屬環境（天氣及地形）與人因複合因素。
根據調查報告中曝光的對話紀錄，8時6分51.4秒，副駕駛兩度警告「教官高度」、「教官現在高度」，正駕駛則回應「知道」，接著在8時7分01.2秒，錄音終止、飛機墜毀。
空軍司令部也透露，空軍經過此檢討，未來空軍救護隊執行專機任務時，調整為2名正駕駛，希望藉此提高人員在遭遇狀況時的緊急應處能力。
