法務部表示，行政院蘇院長早於疫情發生之初，即耳提面命要做好矯正機關防疫措施，防範疫情發生於未然，蔡清祥也秉持蘇院長指示，全面超前紮實部署，除要求全國及外島共51個監所、矯正學校確實遵照中央流行疫情指揮中心揭示各項防疫措施落實執行外，並曾親往監所無預警視察防疫情形，更於日前與各矯正機關首長舉行遠距視訊防疫會議，再三強力要求貫徹各項防疫作為，迄今已有效阻絕疫情入侵。
矯正署長黃俊棠表示，矯正機關環境封閉，收容人數眾多，人員進出頻繁，群聚感染風險始終存在，為強化防範及應變作為，已研議制訂「法務部矯正署因應矯正機關發生武漢肺炎疫情預防及緊急處理計畫」，對於突發「疑似」或「確診」病例能及時加以應處。
矯正署今天在北部地區收容人數最多的台北監獄進行模擬實況演練，部長蔡清祥親自到場督軍，具體檢視該防疫應變計畫是否務實可行及期能增加同仁演練的經驗，至於其他矯正機關，蔡清祥也要求監所人員要儘速進行演練，務必在最短時間內，讓同仁均能熟悉該應變計畫及流程，並能徹底遵行，不容任何防疫破、缺口產生。
黃俊棠表示，此次台北監獄防疫應變演練，以不同情境狀況進行推演，依「疑似病例」、「發現1名確診病例」、「不同場舍有2名以上確診病例」等輕重程度將應變措施分為三級，指揮系統層級亦因應調整為矯正機關流行疫情三級、二級或一級指揮中心，分別由機關首長、矯正署、法務部指派人員擔任指揮官綜理相關應變事宜。
如有確診個案時，於監內落實「分艙分流」原則，包含分房、分舍、分工場及分教區等管制措施，劃定機關運作及勤務配置範圍，規劃人員出入動線及管制，視實際疫情規劃勤務人力調派及輪休，避免感染範圍擴大；戒護人力不足時，依矯正機關分區聯防戒護警力調派人力支援。
此外，以發現新進收容人為疑似病例進行個案操演，執勤人員先詳實調查個案入監前動態，並撥打「1922」防疫專線查核後，由執勤同仁穿戴完整防護裝備，以負壓救護車戒送就醫，個案經確診者立即戒護住院，並同步於監內落實執行隔離潛在感染者，以及後續採檢疫調作業等，全部演練過程逼真、確實，矯正同仁也充分掌握各項應變措施。
