邱于軒挺韓色彩鮮明，多次言論引發爭議，去年5月被臉書粉絲專頁「打馬悍將粉絲團」po影片指出，「在高雄市議會不質詢韓國瑜，卻在質詢民進黨簡議員」，畫面曝光後，引來許多網友批評，其中一名黃姓網友留言：「不要期待破麻辦正事」，還有一名吳姓網友加碼翻出邱于軒過去的爭議言論，說道：「沒有素養的垃圾議員，邱于軒上次還造謠海音開放了民眾只會去上廁所沒錢聽音樂」。
邱于軒在吳姓網友留言底下回應，「已截圖，感謝指教」，又被一名陳姓網友質疑：「邱于軒你在恐嚇民眾嗎？好大的官威。」
根據《自由時報》報導，事後邱于軒對這3名網友提出妨害名譽告訴，在檢方偵辦過程中，她卻陸續對黃、陳2人撤告，最後只告吳姓網友1人。
檢方傳喚吳姓網友到案說明，吳指出，邱于軒的確曾在談話節目中說過「去海音中心最多只是借廁所」，邱也對這個說法道歉，而吳僅是表達自己的看法，留言內容都是事實。
檢方認為，吳姓網友批評邱于軒身為民選議員，卻不對市政質詢，又曾經對海音中心發表過不當言論，雖然內容使邱于軒感到不快，且影響名譽，但吳的內容僅是對具體事實發表評論，罪證不足，偵結處分不起訴。
