「大家表現得很好，我以你們為榮！」本月15日，參謀總長黃曙光在左營主持結訓典禮稱讚，海軍敦睦遠航訓練支隊從帛琉出港後，航行26天沒靠港，任務期間「謹守防疫措施」，確保任務圓滿達成，是全體官兵共同努力的成果。未料，就在第2波境外歐美感染大浪、清明連假危機一一解除，台灣多日傳出零確診喜訊後，18日竟爆出敦睦艦隊磐石艦的群聚感染風暴。
今年敦睦艦隊由磐石、岳飛和康定3艘巡防艦執行出海任務，因應武漢肺炎疫情行程雖已縮短，僅在3月12日至15日停靠帛琉，但744人中至20日仍爆出24人染疫，且確診病例都集中在搭載人數最多的磐石艦；中央流行疫情指揮中心已對可能接觸者發出20萬封提醒簡訊，但國防部對軍艦的防疫措施輕忽，讓確診者足跡遍及全台逾10縣市，已成為下一波社區感染的隱憂。
「既已造成防疫缺口，就要坦誠以對，絕不可以再有任何疏漏！」總統蔡英文19日發出聲明，重話要求國軍徹底檢討防疫作為。本刊調查，敦睦艦隊這次染疫，國軍至少有3大「可預防而未預防」的防疫疏失，包括口罩政策未落實等艦上健康管理問題、返國檢疫隔離不如遠洋漁船標準、下船檢疫措施更遠遜於郵輪，讓全力圍堵病毒入境的府院高層，一度對軍方輕忽及後續處置態度相當不滿。
軍艦染疫衝擊國家安全。親自主持結訓典禮的黃曙光，當天雖全程戴口罩且短暫停留，但仍進行14天自主健康管理。至於9日軍艦返港當天曾前往慰勉官兵，又於16日與黃曙光會面的總統蔡英文，儘管只在岸上揮手致意、2人後續會面的座位也保持社交距離，研判感染風險較低，但醫療團隊已嚴密關注總統健康狀況。
對這次軍艦染疫事件，國防部則表示，將編成專案調查小組，由軍政副部長張哲平任組長，納編總督察長室、軍醫局、政戰局、法律司及海軍相關部門，會配合指揮中心，秉持公開、透明、信任、專業的最高原則，釐清敦睦艦隊任務執行全程的各項防疫作為，誠實面對，絕不隱瞞。
