2018年縣市長大選前，當時爭取連任的台北市長柯文哲又陷入「活摘器官」的風波，作家葛特曼在其著作《屠殺》談及此事，甚至還來台開記者會，向記者表示他認為柯文哲是個騙子，指柯明知中國活摘法輪功學員器官，仍赴中推廣葉克膜。柯文哲對這些指控大為不滿，憤而提告妨害名譽，北檢今傳喚他到案說明。
柯文哲今赴台北地檢署說明案情，在2個小時的偵訊後步出北檢大門，並發表聲明強調自己的清白。柯指出，台灣器官捐贈移植系統是他建立的，所以對這些數據很清楚，他依自己的專業向葛特曼作了一些陳述，「葛特曼不應當把願意出面說明的人，變成是摘取器官的主角，還在選前來台灣說我是騙子。」
柯文哲表示，葛特曼當時來台灣是為了作人權相關的研究，他願意具名訪談，說明他所知道的事，但卻因此被當成罪犯，他完全無法接受，事後葛特曼出書也沒有再來信詢問。葛特曼曾說他並非《屠殺》書中的主角，還答應會修正內容，怎料在《屠殺》2018年要推中譯版時，竟蓄意先推跟他有關的第九章，內容也完全沒有修正。
對於當時葛特曼來台灣發表新書還指控他是騙子，柯文哲認為這是對他的汙辱，也是對台灣醫界的汙辱，更會影響台灣在國際上的形象，會決定提告是因為他受到了不白之冤。
「台灣的法院應是保護公平正義的地方，既然葛特曼敢站在台灣的土地上胡亂指控、栽贓，我也向檢察官提出要求跟葛特曼對質。」柯文哲強調，這不僅是捍衛他的名譽，也是捍衛台灣在國際醫療的信譽。
