黃昆輝指出，1981年底李登輝從台北到南投中興新村擔任省主席的第一天晚上，突然打電話問他，有他沒有帶太太到南投，黃昆輝回答說沒有，李登輝立即說自己的太太也還沒到，想跟他聊聊天，黃昆輝說，依他對李前總統的了解，一定是要討論公事，於是他立刻前往，見面第一句話，李就問他，擔任台灣省教育廳長，有想好第一件事想做什麼了嗎？
黃昆輝立即回答，不只第一件事，第二及第三件事都想好了，當時李說，先講第一件事就好，黃昆輝向李報告，想要解決中小學教師考績獎金不公的問題，當時省屬的中小學教師考績獎金半個月，但台北市及高雄市都是一個月，省議會已經講2、3年了，他與李前總統決定「花插頭前」，在省議會開議前做好，不要等到省議會開議被質詢後才被逼推動，在二人的努力下，2週內就宣布解決了長久的不公平，第一印象就留下深刻的好印象。
此外，當省屬專科、高中、職校長任免遷調一向是關說擾人的案子，李到任後，要黃專權處理，確立賞罰分明原則，以辦學績效與個人風評作為參照標準；同時遷調時採一個遞補一個的方式，增加流動率與鼓勵作用，黃昆輝透露，相關人事作業，都是在晚上做好，一早上班，人事公文已在李的桌子上，李簽名後就發佈了，當時的國民黨省黨部主委宋時選先生還曾笑著說，李主席和黃廳長來了以後的校長調動，就再也沒有關說的困擾了。
此外，黃昆輝也也很羨慕李前總統與妻子曾文惠女士的鶼鰈情深，李前總統第一次到省議會備詢時在休息時間，還曾公開放閃，黃昆輝說，當時李從口袋中掏出一張紙條，說他太太在他出門上班前塞在他口袋，還強調途中不能打開，要到進議會質詢前才能看，李在走進議會前拿出來，紙條上寫著「風吹柳動柳無折」，原來是夫人知道丈夫直率，溫柔叮嚀李前總統脾氣要軟一點，不要跟省議員直嗆。
還有一次李前總統在台中的軍營宴請海地總統，飯後水果是一根很大的香蕉，因為當時李前總統已有糖尿病，夫人曾文惠就跟總統說，這香蕉看起來，很好吃，你能讓我吃一半嗎？只讓李吃一半，成功以柔情控制李的飲食。
至於曾傳出李登輝生先前原想從他1996年總統選舉結餘款成立的李連教育基金會基金用來籌備圖書館，2012年卻傳出該基金會當時董事長、台聯黨主席黃昆輝將經費挪去投資股票失利，餘額只剩5千多萬元，雖是受大環境影響，李也因此與被視為子弟兵的黃關係漸行漸遠。
對此，黃昆輝強調，對於建行漸遠之說，他並沒有這感覺，李前總統是他永遠敬佩的長官，黃昆輝說，1996年李連教育基金會成立，是為了培育青年政治人才，跟籌建圖書館無關，且基金會第一次董事會時，李前總統與連戰前副總統都親臨主持，當時基金會款項約1億7,400餘萬元，為了永續發展，開會決議將部分基金交給專業投顧公司操作，但後來在扁馬二任總統時，遇到3次股市重挫，蒙受重大虧損。
黃昆輝說，李登輝基金會是由群策會改名成立，才確立以籌建李登輝紀念圖書館為主要目標，正式對外募款，後來李連基金會結束運作時，歷年會務支出約1.2億元，結餘款5,200餘萬元則全數捐給李登輝基金會作為籌建紀念圖書館之用。
此外，黃昆輝在2014年也曾協助募款籌得2,300萬作為籌建李登輝紀念圖書館專用，近來還有當年的捐款人表示，希望能落時完成當年的計劃，黃昆輝表示，李登輝對台灣民主有重大貢獻，想到李登輝時，心中滿是懷念與感謝。
