和平醫院封院爭議吵得沸沸揚揚，由於日前馬英九辦公室稱當年封院的決議是「中央下令，地方執行」，引發游錫堃不滿，游表示自己事先完全不知情，之後馬辦再指當時的行政院副院長林信義有在會議上向游報告，2度將矛頭指向自己的回應讓游錫堃忍無可忍，今（27日）動怒回覆稱林信義當時也不知情，並認為馬英九之所以會一再透過辦公室發言就是因為心虛，期望馬拿出良心來，若再繼續硬抝，他就要把當時的資料通通拿出來。
游錫堃指稱，當時和平醫院封院後，自己馬上找馬英九到官邸協助處理，期間也多次通電話，除了協調國防部讓松山醫院成為SARS專責醫院，也成立國家抗疫中心並親自指揮，甚至進口3,000萬片口罩並由政府徵收統一價格；游表示這些迅速的決策都是讓台灣當時成為最早被世界衛生組織（WHO）解除旅遊禁令的原因之一、許多SOP現在也都持續採用。反倒是他要求馬英九要追蹤到和平醫院看過病的民眾，但馬沒有做到，造成一名婦女跑到高雄長庚。
也因此，游錫堃對於馬辦近日的發言感到非常不滿，他認為一直以來他都沒有主動把當時和平醫院的決策好壞拿出來講，SARS期間替馬解決許多困難也沒有對外透露半點消息，如今卻遭到馬辦的甩鍋指責，讓他不悅呼籲馬英九不要再講了，否則他若把手上的資料拿出來，馬只會越講越漏氣。
