指揮中心專家諮詢小組召集人張上淳表示，4大醫療應變策略包含門診營運降載、加強社區監測通報採檢、加強員工健康監測、國際醫療暫停。內容為暫停非急迫性手術、檢查，患者入院前必須篩檢，加強對醫護與員工的健康監測等。
首先是「門診營運降載」：依病人治療的急迫性、需求等，評估病人且綜合考量延遲提供病人診療的風險及疾病傳播的風險後，決定提供或延遲診療。並可延遲診療之醫療暫緩（如：健檢、美容、預定手術或檢查、物理及職能復健等）。
第二是「加強社區監測通報採檢」：病人於入院前一律篩檢，採檢後至入院前待在家中，避免外出。緊急需住院者，於入住病房前一律採檢。倘若病人檢驗結果為陰性，僅能作為當下疾病狀態之判定，但無法排除病人為已遭感染但尚在潛伏期的症狀前期的可能，因此應持續監測健康狀況。病人住院期間若出現發燒、呼吸道症狀、味覺嗅覺喪失、不明腹瀉等武漢肺炎（亦稱新冠肺炎，COVID-19）相關症狀或醫師懷疑時進行採檢。
第三為「加強員工健康監測」：落實工作人員每日體溫量測及健康狀況監測（包括體溫及相關症狀），並確實登錄，有疑似症狀應立即通報採檢。定期（5智7天）針對高風險單位醫療照護相關工作人員（如：急診、加護病房及專責病房等），進行鼻咽或深喉唾液採檢。
最後是「國際醫療暫停（特殊或緊急採專案許可除外）」：指揮中心指出，國內醫療機構相關應變策略，將視疫情狀況滾動修正相關規定。
