國民黨立委賴士葆質詢時指出，本波疫情已造成308人身亡，「3+11」政策是否為本次疫情大破口？陳時中直接否認，「不是，源頭正在查驗」，並表示目前還沒有結果，但也強調「3+11政策是我負責」。
國民黨立委萬美玲也同樣針對「3+11」進行質詢，提問「3+11破口是錯誤政策嗎？是否要道歉？」陳時中則先說明目前還是英國變種病毒株，也因這樣的高傳播力造成現在社區傳播的現象，接著表示，去年底因為相關案件及過年返鄉潮加強防疫，所以嚴格檢視相關防疫措施，而「3+11」是回復到去年的政策，現在還多要求採檢陰性，因此是「更嚴格沒有更鬆」。
而日前中央流行疫情指揮中心宣布，6月12日起，未施打疫苗的機組員返台將進行「5+9」，也就是5天居家檢疫加上9天自主健康管理，萬美玲質疑，如果陳時中認為「3+11」的政策正確，又為何要調整成「5+9」，對此，陳時中解釋，「5+9」是針對沒有打疫苗的機組員，本來對打疫苗的就是要開始放鬆，但萬美玲表示，「3+11」政策施行時機組員也沒有打疫苗就放鬆了，認為陳時中到現在還不願承認「3+11」就是破口，相當遺憾。
陳時中昨日也對本次疫情致歉，但萬美玲表示，如果只有道歉沒有負責，這個道歉就是廉價的，台灣人民都很善良，當行政院長蘇貞昌說現在不要咎責，該做的是趕緊把防疫做好，大家也都給政府時間，「可是台灣人民的善良不是沒有底線的。」
陳時中日前於立法院備詢時聲稱「3+11」決策會議是由副指揮官陳宗彥主持，卻被踢爆陳宗彥根本沒參與相關會議，事後陳時中才表示「記錯了」，改口表示由自己負責這個決定，卻稱沒有會議紀錄，讓監委表態要查，陳時中則解釋，因為每天的會議太多了，所以沒有要求全都做成會議紀錄，「行政上不完備的地方還請監委見諒」，反覆說詞讓外界相當不滿。
