針對好心肝診所違規施打疫苗，黃珊珊表示，自6月2日開始開放醫事人員和診所行政人員施打，希望診所能自己施打院內人員。所以疫苗由市府衛生局評估後配發。好心肝診所上報市府他們有101位醫事人員需施打，第一天6月7號配了15瓶，隔天8號再對市府說有更多需求，希望能夠分到100瓶，因此市府同仁也依照他們的需求撥100瓶，總共撥了115瓶。
黃珊珊表示，稽查結果為6月7號第一批15瓶，事先造冊77名醫事人員施打，但多數造冊醫事人員在外面施打過，因此把領用的15瓶分給基金會跟診所志工施打，共施打172人。第二批100瓶分給好心肝、好肝心診所各50瓶，並為志工施打，共有1,113人完成接種。
黃珊珊指出，依法對好心肝診所罰鍰200萬元，並取消預約合作診所資格。台北市府內部檢討部分，市府員工聽到診所需求時，選擇相信診所需求，未加以查核，認為涉及不法部分送政風處調查。接下來將有更完整規範，將核定權限上升到副局長，以公開透明方式讓大家知道施打順序。
市長柯文哲也表示，內部管控有疏漏，該調查就調查，外面要多少就給多少這樣不對，該送政風檢查或內部調查就該處理。
