全國三級警戒延長至7月12日，就有網友抱怨「全台跟著雙北延長」，台北市長柯文哲則反擊「這是典型政治攻擊」。對此，陳時中表示，「我們面對的是病毒，病毒跑很快，稍微不注意到處流竄，大家要儘速的把自己份內工作做好，相信把疫情控制就會比較好。」並解釋在延長三級警戒的期間，各方面措施做好將疫情圍堵起來，若未來警戒降級後出現疫情，也能及時反應與控制。
媒體追問，有網友認為三級警戒可能會延到中秋後，而柯文哲也指出9月後才能恢復正常生活，陳時中回應，目前三級警戒延長2週，不管疫調或民生產業健康監測專案都要努力，會視努力成果判斷整體警戒狀況。至於指揮中心本月11日宣布配發疫苗給各縣市以提供長者施打，北市府就抱怨遭到突襲，柯文哲今日上午受訪更撂話「（下次）再來我就慢2天（施打）」。對此，陳時中則回應，「打疫苗不要意氣用事」，據各縣市的量能提供民眾最好的服務，至於7月要配發的莫德納疫苗劑量，都已公開讓大家知道。
中央每年會編列預算購買流感疫苗，同時也接受地方政府委託採購，而花蓮縣與南投縣委託藥品業者跟食藥署遞件申請購買COVID-19疫苗，有媒體詢問指揮中心是否會同意？陳時中回應，流感疫苗本就是例行性防疫物資，世界大廠或國內各廠並無限制往來，不過COVID-19疫苗在國際緊縮的情況下，整體各大藥廠基本態度都只跟國家往來，因此兩者層級是不一樣的。
陳時中指出，地方政府有資料的話，指揮中心就會檢視，要確定有明確資料且真的可以購買的到，畢竟COVID-19疫苗是重要物資，免得大家很熱心，但整體上廠商不會與地方政府往來。另外，針對前副總統呂秀蓮聲稱，2個國際組織致函給總統蔡英文，表達要協助購買3,000萬至5,000萬劑嬌生或BNT疫苗，指揮中心是否有掌握並比照台積電、鴻海模式？對此，陳時中表示，目前未接到相關文件，會密切注意。
疫情監測組組長周志浩補充說明，流感疫苗與COVID-19疫苗的差異，流感疫苗在各國要取得藥證，而COVID-19疫苗則是各大藥廠僅有「緊急使用授權」許可，藥廠對於購買者負擔的義務差別非常大，因此國際大藥廠都要找國家政府來接洽，這跟流感疫苗的狀況完全不一樣。
近日傳出秘魯變異株（Lambda）已侵襲29國且逐漸擴散，世界衛生組織（WHO）就警告傳播速度更快且抗藥性恐會更強。屏東昨日就公布一名計程車司機染疫，疫調匡列後發現乘客、好友及家人都相繼確診，且乘客親戚為從秘魯返台的祖孫（案13332、案13333），外界就憂心是否有秘魯變異株侵台可能？對此，陳時中回應，有需要的話就會做病毒基因定序，詳細情況要再進一步了解。
中國四川衛健委今日通報，昨日新增3起境外輸入個案，其中2例為自台灣搭機抵達成都。對此，發言人莊人祥指出，上午8時許有收到中國的通知，會針對資料去了解個案在台灣的住址，並連繫其同住親友做後續調查。針對台灣輸出個案，陳時中坦言，台灣在有疫情的時候，這樣的情況相對會增加，這是很正常的事情，「國外人家幫忙驗出來，國內進行疫調，萬一有隱形傳播，也可以及早發現。」
德國總理梅克爾先打AZ疫苗、後接種莫德納疫苗，且國際有研究指出，混打不同品牌可增加疫苗保護效果，有媒體詢問，指揮中心是否會繼續禁止混打？陳時中澄清，「我們並不是禁止，是沒有開放」，認為要讓科學證據更明確一些，而就部分名人採取混打疫苗情形，他表示不知其是否有特殊醫療上的考量，這些都僅是個案，還是希望有公開的科學訊息作為參考，專家提供相對正確的方向及大數據下，要如何做才會對民眾最有利是指揮中心一直思考的方向。
