台中市傳出有5名長者隱匿接種紀錄，闖關成功混打AZ疫苗與莫德納疫苗，無獨有偶，基隆市也有2名接種過AZ疫苗的醫師企圖混打遭到阻止。媒體詢問，是否會對違規混打者開罰？陳宗彥回應，有關意圖或刻意混打者都會交由指揮中心法制組研議，指揮中心也已呼籲各縣市大型接種站及醫療院所，一定要落實民眾接種時健保資料檢查，並落實每個步驟以避免類似情況再發生。
世界衛生組織（WHO）首席科學家斯瓦米納坦（Soumya Swaminathan）建議，民眾不要自行決定混打疫苗，並稱這是一個危險趨勢。針對混打疫苗疑慮，醫療應變組副組長羅一鈞指出，WHO並未明言可混打、也沒說不行混打，因此是建議照一般標準兩劑施打同品牌疫苗，也尊重各國實際到貨疫苗狀況，與各國進行混打的試驗。至於國內台大醫院已進行混打AZ疫苗與莫德納疫苗的研究，羅一鈞表示，3個月應該就有結果，希望再提供給大家相關驗證。
有媒體指出，有民眾在台灣接種第一劑AZ疫苗後，到其他國家再施打第二劑不同品牌的疫苗。陳宗彥表示，目前國內都有詳細規劃，「國人真的不需要特別去飛到其它國家來做施打」，以目前情況，民眾相當有秩序地作意願登記，加上國際疫情尚未趨緩仍處於上升階段，因此特別飛到國外打疫苗可能增加飛行旅程的風險，「這也不必要」。
此外，有專家認為即使7月底疫苗覆蓋率達25%，但解封後民眾外出活動機會多，仍可能造成疫情爆發，恐會面臨再次封城。陳宗彥回應，本月13日起放寬管制措施，因此會從管制措施、防疫計畫、疫情發展、疫苗接種等進行綜合評估，後續會如何降級會將防疫計畫是否能落行作為一併考量。
