《NHK》報導，日本首例Delta病毒株案例為5月18日於一名住在東京，從未出過國旅行的人身上檢測到，進一步追查，發現與4月16日一名在機場檢疫確診病例基因數相同，傳染病研究所推定，Delta病毒株就是以此為起點流入首都圈，再擴散到全國。
關東、關西、中部、九州等地5月前後的確診患者，也都是感染海外流入的Delta病毒株，所以沒有造成大規模感染。但現在Delta病毒株已占東京市區所有感染數的90%、關西則超過60%。
根據傳染病研究所委託民間檢測公司調查數據指出，目前關東Delta變異株及相關變異株病例，東京、神奈川、埼玉、千葉縣等首都圈已達到9成，關西部分，大阪、京都、兵庫等首都圈病例數急速增長，到8月下旬將超過8成。顯示Delta變異株及相關變異株，將替換掉原本的病毒株。
專家會議主席脇田隆字表示，Delta變異株的感染力是原本病毒株的兩倍，若用與過去相同的防疫政策恐難以應對，不只要抑制感染擴大地區的人流，也要減少人與人接觸的機會。
