卓伯源認為,2022年縣市長選舉,只要國民黨與其他在野政黨有共同理念,就可進行結盟合作。例如,台北市首都是重中之重,目前以國民黨立委蔣萬安呼聲最高,「台北市國民黨比較強,那就推國民黨提名的候選人參選,(當選後)相關友黨就加入市政團隊,大家可以結合。」他形容,就像西方聯合內閣概念一樣,無論對方是親民黨或民眾黨,都應該採正面的態度來合作。
卓伯源也分析國民黨2022年選情,表示疫情期間藍營縣市長的防疫表現大多深獲民眾肯定,要連任問題不大,「這是他們(縣市長)自己的功勞!」跟黨中央及主席一點都沒關係,他接著意有所指地說:「江啟臣當立委又要兼主席,對他實在太辛苦了。」
他接著以新北市長侯友宜為例說,侯率先提出方倉醫院的概念,也提出入境普篩,但這些意見提出來時,馬上就遭到綠營圍剿;另外,彰化縣衛生局長葉彥伯在疫情爆發前,為了斬斷社區隱形傳播鏈,曾提出精準篩檢的主張,也遭疫情中心指揮官陳時中移送政風單位調查,「他們在受質疑、受打壓的時候,黨中央有幫他們發聲嗎?沒有!」因此,他再次強調黨主席必須專職,才有辦法全心全力為黨付出。