民進黨執政團隊晚間分頭舉行記者會，由總統蔡英文打頭陣、行政院長蘇貞昌在行政院接棒，最後由民進黨祕書長林錫耀在黨中央說明結果。
蔡英文晚間在副總統賴清德、民進黨立院黨團總召柯建銘陪同下，於總統府舉行記者會。蔡英文謝謝參與公投的台灣人民，她說，無論投下同意或者不同意，都是公民意志的展現。她強調，公投沒有誰輸誰贏的問題，只有國家未來怎麼走麼問題；這次公投傳達4個明確訊息，台灣人民希望走向世界、台灣人支持能源轉型，並期待穩定供電維持經濟成長動能、台灣人民重視生態環保，希望經濟與環保雙贏，台灣人也期待公共政策能被理性討論。
蔡英文說，穩健執政是政府一貫原則，各種想法政府都會納入政策評估與規劃，她感謝賴清德、蘇貞昌、柯建銘與所有執政團隊同仁，這幾個月透過一場場說明會，讓大家了解施政方向，爭取台灣人民支持民進黨主張。她也感謝許多公民團體，透過溝通討論找到共識，找到對國家發展最好的方案，一起證明「民主是奠基在成熟的公民社會之上」。這次公投辯論獲得許多專家學者的協助，她也對這些學者表達感謝。
蔡英文說，透過民主機制，不同意見可以互相溝通說服，人民意識也可以凝聚價值選擇，眼前還有很多挑戰，她再次感謝台灣人民參與公投，承諾「執政團隊會秉持人民託付，繼續努力，讓台灣一天比一天好」。
蘇貞昌率公投相關部會首長舉行記者會，他用「非常圓滿的結果」來形容這次公投。蘇貞昌說，今天天氣不是很好，有些地方還下雨，但全台灣有800多萬國人走出家門，對並不是很簡單的公投題目表示清楚意見。如今結果出來，他很感謝國人用最直接的民權表示對政府政策的堅定支持，有了這樣的支持，政府更有信心，也知道要更努力完成人民的託付，讓台灣走出去，讓能源轉型走下去，讓民主更深化。
媒體關切接下來是否會有內閣改組，蘇貞昌說，有政黨把公投操作成倒閣公投、不信任投票，這都偏離公投意旨。人民已經用權力行使來表示對事情的意見，而他做為行政院長，就是努力帶團隊為人民服務、為國家做事，未來也會以這樣的態度，繼續為國家做事、為人民服務，這一點跟公投沒有相關。
蘇貞昌說，公投是就事論事，跟人沒有關係，所以也跟改組沒有關係。至於國民黨內的「戰犯」風波，蘇貞昌說，「我們沒有評論」。
對於國民黨主席朱立倫批評「公投已死」，林錫耀說，公投結果是800多萬人一票票做的決定，就是人民自主意識的展現，不能說結果不符期待，就批評公投已死，這點我們完全無法接受。
