北大因三峽某國小教師染疫案延伸，4日有1名學生染疫，校方為避免師生群聚感染，即宣布「5至10日停止到校，全面改線上教學，11日恢復實體上課」，孰料8日再添2名學生染疫，使該校累積3人確診，依規定要全校停課10天，但北大卻決定於11日恢復實體上課，引發學生不滿。
北大學生會8日於Dcard以「恢復實體授課，不召開防疫會議，罔顧學生會意見，本會深感遺憾」為題發文，對於校方恢復實體上課的決議是否符合專業判斷，質疑「無校內足跡，即認為本校沒風險」，並直指同為北部學校的北市大、中原、輔大、師大、海大及東吳等多校亦宣布至少至下週（10至16日）為遠距教學，為何獨以台北大學沒有，最後自嘲「我們是在結界上課嗎？」
北大學生會直指，校方稱9日會召開防疫會議，卻又決議恢復實體上課，政策反覆將會讓學生無所適從，並點出，由於這幾天遠距上課，「很多同學這幾天在家，沒有攜帶所有教科書及筆電等，不是沒讀書，是沒書讀」，即使請人幫忙寄恐怕東西還沒到，人就返回校園了；同時也點出多數學生亦有兼職，回歸藏有風險的學校，屆時被匡列或確診根本無法打工維持生計，而住雙北的學生家裡長輩又該如何是好。
對此，台北大學回應，8日確診的學生，是連假在外縣市確診，並沒有學校足跡，加上11日這週適逢期中考，因此校方討論後決定恢復實體課程；校方補充，學校防疫作為，都有呈報教育部，強調一切都有遵守防疫規範。據《自由時報》報導，教育部主任祕書廖興國10日表示，「校園因應『嚴重特殊傳染性肺炎』疫情停課標準」，明載校園2名師生確診要停課10天，是要染疫者有校內足跡才算。
