根據目前規定，在PCR確診COVID-19後，需經過醫生評估才能取得抗病毒口服藥，而指揮中心今（12日）起調整確診認定，3類人（居家隔離、自主防疫與居家檢疫者）快篩陽性等同確診，為方便民眾領藥，也開放親友代為看診，以評估使用口服抗病毒藥物。
然而柯文哲昨（11日）在北市議會就表示，他認為應該要快篩陽就給藥，因為快篩陽到PCR出來還要幾天時間，而抗病毒藥應該在發病內5天要吃，過後效果就很差，因此他主張要放寬給藥標準。
柯文哲今赴聯合醫院忠孝院區視察視訊診療流程時，再度談及給藥問題，他指出，目前快篩陽性後PCR確診的比例已達93%，除非是保險或法律需求應該要PCR證明文件，他認為醫學臨床上應將快篩陽就直接視為確診，並即時給藥，否則若堅持PCR後才給「一定會死很多人」。
但有醫生持不同意見。《三立新聞網》報導，胸腔科醫師林永淵認為目前國內的狀況還不太適合在快篩陽性就用藥。林永淵指出，目前由輝瑞公司出品的Paxlovid口服抗病毒藥物「藥物交互作用比較多」，由於很多老人家都有服用血糖、血壓、心臟病等慢性病的藥物，如果肝腎功能比較不好，貿然投藥的話會產生副作用，因此還是經醫生評估來投藥比較好。
立委林靜儀也分享衛福部疾管署公布的「COVID19抗病毒藥仿單」，說明可能會有藥物交互作用的藥品，有些會導致藥效干擾，有些會造成呼吸抑制，有些可能產生心律不整。
林靜儀說，台灣已是知識普及、公衛概念足夠的國家，應該不要再有什麼 「有病治病沒病強身」或聽說什麼藥很厲害就吃吃看的文化。她也重申，中重症患者會收治住院，而一般輕症患者不需使用藥物，只有免疫力低下或特殊慢性疾病患者需要經醫師評估後給予抗病毒藥物，協助降低病毒量，最後更強調：「沒有一種神藥是每個人都可以隨便吃的！中藥西藥都是！」
