張惇涵指出，蔡英文總統非常肯定國防部邱國正部長的表現，沒有異動打算，邱國正不但治軍嚴謹，各項強化自我防衛能力的軍事建案也如期如質推動，且各項國防改革計畫也落實執行當中。對於國際及區域軍事局勢的精準分析研判，對於協助蔡英文及國安團隊的重大決策，具有重大貢獻。
針對報導中提到蕭美琴與陳文政曾在電話中爭執，張惇涵表示，完全捏造不實、離譜至極，兩人根本從未有過任何爭執，且內容提到陳文政不能直接以書面、電話或口頭向蔡英文報告也並非事實，實際上陳文政皆有參與蔡英文的定期軍談會議或各項軍事專案會議，也本於職責，必須向蔡英文報告。
張惇涵指出，近來部分媒體不斷炒作國安會與國防部之關係，這種炒作毫無意義，也其心可議，國安會與國防部皆是國安團隊的重要份子，「一個團隊、一個目標」，皆是以提升國防戰力、強化國家安全為目標共同努力，面對當前複雜多變的國際局勢，這類企圖打擊軍心士氣的臆測及傳聞應適可而止。
