吳淑珍6月10日在台南奇美醫院PCR陽性確診，隨即服用抗病毒藥物Paxlovid。陳水扁當時表示，吃藥會有副作用造成拉肚子、食欲不佳，讓吳淑珍原本就虛弱無力的身軀更加雪上加霜，連推輪椅的力氣都沒有，說話也不清楚，「整個人好像風中殘燭即將熄滅」。他請醫護人員來家裡幫吳淑珍打安命活源注射液，再加上高蛋白的艾爾補定注射液，他認為要有好的體力才能對抗新冠病毒，「否則病毒還沒消滅先被自己打敗。」
吳淑珍原本採居家照護，但後來住進高雄長庚醫院，情況才逐漸穩定，原訂6月20日解隔離，但主治醫師林副院長說多項指數還是不正常，認為仍需進行其他必要檢查，因此多住院幾天，「扁嫂受染疫影響而有幻覺精神恍惚，離開病床坐上輪椅因疲累沒辦法久坐」，且她講話時血氧濃度會掉，慢性用藥還要調整。
吳淑珍在6月24日經由醫師同意出院，由於血氧濃度不足，回家途中還戴著鼻導管。陳水扁昨（3日）深夜透露，經高雄長庚測量體重，確診住院後的吳淑珍只剩下32公斤，最近在回診時因為檢查需要，必須抽血，他擔心吳淑珍的身體狀況怎麼負荷得了抽太多血，「果不其然抽完血就昏倒了」。
不僅量不到血壓，血氧濃度也顯示不出來，陳水扁感嘆：「這已經是吳淑珍的日常」，他目前除了全心全力照顧，也只能祈願上蒼保佑了。
