台北地檢署2017年偵辦大巨蛋案時，檢察官也發現2004年9月20日，馬英九在台北市長任內與遠雄集團負責人趙藤雄密會，另李述德在議約會議錄音中指到，「乙方代表提出一些數據，我們覺得不是很理想，後來府裡面，這個、這個研究之後，認為假定我們這邊要提一些營運權利金，將來都市計畫變更還是有一些這個、這個、這個，所以我們認為二個辦法一起，不要說一隻牛剝二次的皮，對市政府也不利，對他們（指遠雄）也不利。」
李述德當時在會議中說，在這樣邏輯之下，「府裡高層認為乾脆這部分我們就不提，他也不提，我們也不去要求了，完全倒回到都審的那個程序做處理，這比較明確一點…這確定了吼。」最後會議紀錄果真刪除營運權利金，外界質疑李述德所說的高層，指的就是馬英九，因此檢察官曾鎖定馬英九進行偵辦，檢察官也傳訊馬英九及其他在場人士作證，確認馬英九當時並未允諾「零權利金」。
2017年台北地檢署認定，李述德涉嫌在大巨蛋案中圖利遠雄集團，強行曲解法令，主導變更契約條款，營造對遠雄巨蛋公司有利的興建營運條件，導致不公平競爭，使北市府承擔因取得大巨蛋案土地而須支付的高額舉債及利息，損失鉅額利潤，依圖利等罪將李述德起訴並求刑10年，今台北地院一審判他9年；仍可上訴。
