薛瑞元日前參加民進黨總統參選人賴清德高雄的中醫師後援會活動，於替其助選時表示，柯文哲自己是ICU醫師出身卻支持安樂死，柯一定知道安樂死要如何做，因此他很想問柯：「有一天台灣如果真的安樂死合法化，你要當第一個去執行安樂死的醫師嗎？」薛更表示他認為柯不敢、只是隨口說說，並酸「反正他也選不上」，可以之後再推說自己沒選上。
對於薛瑞元的發言，時代力量發言人林易瑩則是批評「政府的輕率態度令人瞠目結舌，也非常遺憾」。林易瑩強調安樂死獲台灣社會支持具高度共識，薛身為部長卻以輕率的發言推諉搪塞，相當失格。此外，時代力量稱也已經將台灣首個安樂死公投的提案人江盛醫師列入2024不分區立委參選人名單，並積極推動安樂死合法化，希望與社會深入探討安樂死的議題，依據高度民意找出具體方案。
薛瑞元今出席活動被問及此事則再度回應，他表示，安樂死違背醫師誓言，世界醫師會也不贊成，推動安樂死的重點不在於解決病患疾病末期之痛苦、積極利用藥物幫助患者離開，而是「執行者是醫師」，因藥物都是處方藥，要醫師才能開立。
薛瑞元強調，時代力量有表達意見，他個人立場則認為這違背醫師倫理、違背醫師誓詞，而衛福部身為官方機關、負責管理醫師是人員，不適合帶頭推動安樂死。薛瑞元也稱，若是透過民間或黨團力量推動，使安樂死合法化，衛福部只能接受，因這是民主程序，但他個人「絕對不會去當這種醫師」。
