近日有北一女學生在網路匿名PO文，爆料區桂芝在課堂上灌輸偏頗的政治立場。對此區桂芝受訪表示，古典文學有很傳統文化經典，在教學過程為生活化教學，會適時以新聞時事舉例與現實作連結，不免會有意識形態的展現，但強調只是提供自己的觀點給學生參考，藉此養成學生獨立判斷的能力，並未強迫學生接受。
區桂芝表示，在課堂上所提供的是一種看法，而每一件事情都不單只有一個看法，若學生不認同在課堂上反駁，自己也不會因而當掉學生，直言台灣是個言論自由國家，尊重每個人看法，也會建議學生將不同意見帶回去想一想，或許長大了，看法也會不同。
區桂芝也強調，針對有些學生指課堂上不敢反駁，回去後透過網路或跟家長說，她上課都在講政治，這些都是不實指控，不過因自己的言論，讓網軍紛紛出動，區桂芝質疑貼文未必是北一女學生所發，相信自己跟學生感情很好，對於指控認為沒什麼好回應的，也不在意外界貼給她什麼樣的標籤，更引用蔡英文說過「沒有人需要為他的認同而道歉」，沒有必要道歉。
至於外界質疑她以公立學校教師身份赴港研習，恐違反規定，據《ETtoday》報導，區桂芝也做出回應，直言教育部搞不清楚狀況就說要查明，「欲加之罪，沒什麼好說的」，表示自己是應國學大師錢穆所創辦的素書樓文教基金會邀請，利用暑假時間參加交流研習活動，「沒有什麼問題，教育部要查就來查」。
