根據日媒《NHK》報導,日本國土交通省透露,事發當時,福岡機場管制員已經指示日本航空的客機在進入跑道前的「滑行道」停止線前停下,但該客機卻無視指示繼續前進,管制員見狀後連忙再次提醒機師,最終才在入侵跑道的最後一刻停下。
而J-Air的客機當時正準備以時速120公里起飛,卻被日航客機逼近,所幸J-Air接到管制員通知後,及時緊急煞車,才躲過一劫,讓機上共47名乘客及機組人員都平安無事。當時J-Air客機停下的位置和日航班機僅有數百公尺的距離,若2架飛機中有任何一架未能及時停下,後果將不堪設想。
另外,由於J-Air客機當時緊急煞車,其機身必須接受安全檢查,因此該航班被迫取消;對此,日本航空公司也發表聲明致歉,已將此事向民航局報告,並承諾未來會在民航局指導下,與相關部門合作釐清事發原因,以防止類似事件再次發生。