根據台南市環保局的初步調查，死魚的主要原因是水中溶氧不足，可能是連日來高溫天氣所致。環保局在安南橋附近進行了水質採樣，測得水溫為33.4度，溶氧濃度僅有2.66mg/L，pH值為7.34。死亡的魚隻平均長約23公分，已死亡3天。
市府環保局表示，嘉南大圳昨（4日）下午發現大量死魚後，立即通報水利署和相關單位進行清理和採樣分析。清理行動主要集中在安南區的郡安路5段至6段之間，目前已清除了200多公斤的死魚，並持續進行清理工作。
台南社大台江分校表示，他們的環境觀測活動中發現類似的情況，特別是在安順寮排水線和嘉南大圳下游，也有大量死魚漂浮或擱淺在岸邊，並持續流向四草湖。
