日本防衛省指出，26日上午11時許，共軍Y-9情蒐機入侵長崎縣「男女群島」近海的日本領空，時間約2分鐘，日本航空自衛隊從宮崎縣、福岡縣基地緊急出動F-15、F-2戰機，對共機發出警告。
《NHK》報導，日本外務省事務次官岡野正敬當天即召見中國駐日臨時代理大使施泳，表達日方嚴重抗議，強烈要求不再發生類似事件。
內閣官房長官林芳正今在記者會上再度表明日方態度，他強調此事不僅是對主權的嚴重侵犯，也是對安全的威脅，「是完全不可接受的。我們對此表示強烈抗議，並敦促他們制止，以免再次發生。」
林芳正表示，他不會針對中國軍機的行動、意圖或目標給出明確答案，「但日本附近的軍事活動有擴大、更加活躍的趨勢」，日本方面會採取一切可能錯失，打擊侵犯領空的行為。
日本防衛大臣木原稔也說到中國近年在日本週邊的軍事活動有擴大、活躍的趨勢，中國軍機的意圖和目的需要加以分析，日本將透過防衛省和自衛隊的監控持續掌握並採取預防措施來應對；日本外務大臣上川陽子更表示，日本政府會堅決保護日本的領土、領海和領空，並持續冷靜、堅決應對，堅持應該堅持的事情。
