針對指控，南投縣政府表示，關正觀雜誌社案，係審計部南投縣審計室來函本縣，已有稅籍登記而未辦理商業登記，要求本府函請各商業辦理商業登記案件，本府遂於發函請該雜誌社等各商業辦理商業登記。 本案本府對於本縣商業登記輔導，皆採積極輔導。本案是請正觀雜誌社有營業需要辦理商業登記，非屬寺廟管理相關事宜。
針對靈山禪寺案，係民眾陳情靈山禪寺有發生露天燃燒的情形，環保局前往現場時，發現有燃燒痕跡，但未發現行為人。故依空氣污染防制法及行政程序法規定要求土地所有人說明。經土地人回應非行為人，環保局將依其回應結案。
針對鄉長違反廢棄物清理法案，係環保局依權責拆除懸掛於路口、電線桿上的違法布條時，鄉長與自救會會長前往警察局告發環保局人員毀損其布條。因此環保局認定鄉長及自救會會長為非法懸掛布條之行為人，故依廢棄物清理法規定裁處6,000元，並要求限期移除懸掛的布條。 以上本府均依法行政，並無立委關心或未依法辦理之情形。
