該共諜案嚴重影響國家元首級的維安，已知遭外洩給中國的資料，包括賴清德在副總統任內出訪巴拉圭等地的飯店住宿細節、2023年總統大選時行程，以及外交部長吳釗燮與友邦使節或外賓談話紀錄，甚至包括會晤人員、餐宴地點與轉機時間都遭外洩。此外，國安等相關單位針對我國與美國、中國等國家，在貿易、軍事與外交的戰略分析，也遭竊取外洩。
知情人士進一步透露，賴清德在競選總統時的海內外行程，包含抵達機場、下榻飯店及住宿房間樓層都因此被對岸全盤掌握，一旦有心人想埋伏攻擊，恐讓賴陷入高度危機。
全案扮演關鍵角色的黃取榮，外界只知他是綠營資深黨工，曾擔任新北市議員李余典特助，離職後因西進中國經商遭吸收。本刊調查，黃早在10多年前赴中國就讀廣州暨南大學時就被鎖定，中國官方透過一名叫陳過的情報人員，出面與黃接洽，雙方建立關係後，成功吸收黃成為共諜。
「黃取榮與交付關鍵機敏資料的何仁傑、吳尚雨，沒有直接接觸的紀錄。」知情人員透露，黃取榮是透過邱世元擔任中間代理人，再由邱找上何仁傑及吳尚雨，不論交付情資或報酬，都採單線作業；羈押後，僅邱世元被檢調突破心防，坦承大部分罪行，其餘3人一概否認犯案，但邱的供詞已讓綠營共諜案的組織架構及相關金流曝光。
