疾管署指出，國內新冠肺炎疫情上升，第22週（5月25日至5月31日）新冠門急診就診計62,755人次，較前一週上升49%，增幅較先前一週略減緩，但仍需觀察端午連假效應對本週就診人次之影響，預估6月份仍呈上升趨勢，高峰仍預估將落在6月底7月初。
疾管署提到，5月27日到6月2日新增132例新冠併發重症本土病例及15例本土病例死亡；今年新冠併發重症本土病例累計564例，其中81例死亡，均以65歲以上長者及具慢性病史者為多，確定及死亡病例未接種JN.1疫苗者均近9成，國內目前主流變異株為NB.1.8.1。
疾管署指出，全球近期新冠病毒陽性率呈上升趨勢；鄰近國家馬來西亞、新加坡、澳大利亞疫情皆呈上升，另香港流行變異株以NB.1.8.1為多，疫情仍處高點，但開始呈下降趨勢。
疾管署統計，國內新冠JN.1疫苗已累計接種222.6萬人次，上週（5月26日至6月1日）接種約6.9萬人，為前一週（5月19日至5月25日）接種4.1萬人的1.7倍，再創近3個月以來單週新高。
經統計，目前全國JN.1疫苗接種率9.12%，65歲以上接種率分別為第一劑18.85%、第二劑1.14%，請年齡滿6個月以上且尚未接種民眾儘早接種，另已接種1劑且間隔6個月（80天）的65歲以上長者等3類高風險對象，應再接種第2劑，提升免疫保護力，降低重症或死亡發生風險。
