南門市場是台北市最著名的傳統市場之一，以南北貨著稱，市場處2012年發現大樓五樓以上海砂含量超標，還先進行減重及結構補強，將行政單位搬離大樓，並進行結構補強。
北市府人士指出，柯文哲明年尋求連任，包括環南市場、南門市場都是會被地方檢驗的指標政績，目前進度都嚴重落後，以南門市場為例，市場處原先規劃預計2018年3月中繼市場開工、2019年4月完工，南門市場大樓2019年6月拆除，但目前中繼市場是否回到華光社區，在當地居民及攤商反對下，仍無法敲定，也考驗柯市府落實政策的決心。
南門市場自治會長王詮國表示，他曾跟柯P說過，「馬英九在市長任內，毀掉建成圓環，難道你任內拆遷南門市場，將來也要背負一樣的罵名嗎？」柯P當下拍胸脯保證，他絕對不會跟馬英九一樣犯一樣的錯。
王詮國說，華光社區特四及特五預定地在大安區，一旦搬遷該處，附近的東門市場販售的熟食品項，將會與南門市場攤商形成一定的衝突，屆時兩個市場的攤商生意一定都會受到衝擊，因此才會希望市府儘可能把中繼市場安置在中正區。
