林氏璧今（6日）在部落格內貼文回應指出，感謝各方的指教，他虛心接受處分，並強調長久以來維持醫院醫師和旅遊部落客的2個身分，身心俱疲，已萌生辭意。因此，在這個記過判決出來之前，已經從醫院離職。而他離開並不是因為這個檢舉，而是無法兼顧2個身分，他感謝國家，院方長期以來的栽培，他強調，感謝那些攻擊他的人「如果不是你們，我不會走到今天的規模。」
孔祥琪經民眾向法務部廉政署檢舉，指稱他經營商業旅遊部落格，包括林氏璧和美狐團三狐的小天地部落格及日本自助旅遊中毒者臉書，台大醫院調查認為，這些落格網站內容，除了介紹日本旅遊相關資訊外，還有接受廠商試吃邀約、試住邀約、工商服務、分潤、代購等商業行為，已違反公職人員不得兼職的規定。
對於指控，孔曾表示部落格是由他本人及妻子掛名共同作者，因他平日工作繁忙，多半內容文字為妻子撰寫完成，他僅於公務之暇提供旅遊時所攝照片，於編修後供部落格使用；另部落格整體經營規劃也是由其妻依其意志主導完成，其衍生相關收入屬於妻子公司，他並無擔任公司任何職務或持有股份；寫部落格都是利用下班或休息時間，並沒有違法。
台灣大學醫學院的主管單位教育部認定，落格寫到「男主人林氏璧負責旅遊教學，攝影，住宿文…林氏璧負責主筆，大家看到的文章9成5都是林氏璧寫的」與孔祥琪說文章都是妻子寫的不符，且部落格還建議廠商代表一次邀約孔及妻2人出訪日本，各司其職以完成部落格寫作，加上部落格架設提供大量的工商服務及分潤等訊息且不斷更新，及據網頁內容所載2013年9月至11月平均1天的瀏覽網頁量各超過2萬。
此外，自孔祥琪自2013年10月起至2017年8月止請假赴日旅遊、辦事及個人急事須處理多達35次，教育部認為，此部落格提供欲旅日民眾景點、住宿、吃、交通及赴日網路使用等相關訊息，裡面旅遊文章9成5是孔祥琪所寫，且與其妻共同赴日接受廠商邀約以撰寫網頁，及赴日次數異常頻繁，網站架設整體呈現是以獲取利益之營利目的，均日網頁瀏覽量達2萬以上，孔祥琪所說幫忙家人經營商業的講法不成立。
台大醫院於2017年10月23日召開員工考績委員會議審認，孔祥琪違反《公務員服務法》第13條第1項公務員不得經營商業規定，由教育部移送公懲會審理，孔祥琪並未至公懲會答辯，但合議庭認定，孔祥琪違法屬實，行為足以使民眾產生公務員不專心自身業務，公務紀律鬆散的不良觀感，嚴重損害政府信譽，予記過一次。
