賴清德也還原吳茂昆請辭原因，吳於2005年10月擔任國科會主委時，向行政院請假出席在中國舉辦的2場國際會議，參加完第1場在蘇州舉行的國際學術會議後，應吳恩師、知名學者朱經武邀請，利用週末前往浙江再參加由香港科技大學、浙江大學共同舉辦的國際學術高峰會。
賴清德說，吳茂昆最近才知道這2場國際的研討會，當時行政院只准了第1場國際會議，所以他認為自己身為教育部長，應用同一標準、甚至更高道德標準檢驗自己，所以希望辭去教育部長職務，希望止住紛爭，讓教育部工作能順利推展。
至於教長人選？賴清德僅說，在吳請辭後，會先由次長代理，繼任人選會擇期再跟社會大眾報告。賴清德受訪後隨即轉身進入立法院議場，不接受其他提問。
