馬英九三中案為重大金融案件，7月12日台北地院由發言人黃柄縉庭長、刑庭庭長葉力旗，在媒體見證下，從籤箱中抽出「理」股的鄭昱仁法官承審，由重金庭的刑16庭審判長胡宗淦、受命法官鄭昱仁、及陪席法官高若珊合議審理，由於受命法官8月29日將調職司法院、陪席法官將辭職，2人的異動案在抽籤前已核定，承審合議庭的成員到8月29日後將會有所變動，3位法官將有2位更換。
本刊調查，北院依慣例採法官自願及法官彼此推薦方式，日前已選出林呈樵與林幸怡2位法官加入重金庭的刑16庭，2人分居被推薦前2名，此一方式在2012年前總統李登輝遭起訴涉國安祕帳案中也適用過，當時受命法官林柏泓、陪席法官何俏美調職在即，因此依法官自願及彼此推薦方式，由胡宗淦出任新受命法官（現為北院審判長，承審馬英九案），陪席改為葉力旗（現為北院庭長），當時審判長則為目前的法官學院院長周占春，當時胡宗淦及葉力旗2人各獲最高票推薦，均為19票。
林呈樵在擔任法官前，曾在補習班以「喬台大」授課，並出版《家事事件法焦點掃描》等《民法》國家考試用書，非常暢銷，至今仍有版稅進帳，林呈樵曾審理過台大宅王張彥文殺害前女友案，也審理過前行政院長江宜樺在323太陽花學運政院喋血事件遭控殺人未遂案，江宜樺案審理期間，有網友發現林呈樵曾在個人臉書上發表支持學運的見解，質疑他的立場，最後林呈樵判江宜樺案自訴不受理。
馬英九三中案，台北地院已於8月3日由原受命法官鄭昱仁首度開庭，先針對張哲琛、汪海清及前立委蔡正元妻子馬尾妹洪菱霙3人是否續限制出境審理，3人數後仍遭法官限制出境，8月17日將審理同案被告蔡正元是否續限制出境，馬英九等人實質審理部分，由於馬英九的委任律師團仍在閱卷中，8月29日受命鄭昱仁法官調職前暫不會開庭審理馬英九部分，預計由新任受命法官到職後審理。
此外，今天法官論壇網站中有法官發文，認為即將回任台北地院的高院法官林孟皇適合審理前總統馬英九三中案，因林孟皇未填意願加入北院重金庭，且他曾告發過中影案，必須迴避審理相關案件，因此前總統馬英九三中案確定不會由林孟皇接手審理。
