儘管就任時，校方曾公開祝賀法學博士校友當選台灣總統，總統蔡英文的英國倫敦政經學院博士學位仍屢遭質疑，從學位證書上的校長名字到學校鋼印都曾被政經節目拿來大做文章，倫敦政經學院已多次發文，還原蔡英文學位和論文清白，並表示校方同事都不堪其擾，並感嘆為何台灣部分人士只有在總統大選前才對這本論文如此好奇。
日前連馬英九執政時的陸委會主委賴幸媛，也看不下去抹黑，忍不住跳出來為蔡英文說話，表示雖然自己及以前的國安團隊，都對蔡總統這幾年的施政與治國能力高度不滿意，但是她的LSE博士學位是真的，事實就是事實，並透露當時蔡英文很快就拿到博士學位，不到3年就口試通過，當時包括外國朋友們都認為她很厲害。LSE台灣校友會也引校訓挺蔡英文，表示「沒有任何一位合法取得學位的校友應遭受這樣對待」。
日前名嘴又將砲火集中攻擊蔡英文的博士論文，指稱那篇論文沒有人看過，又稱該論文涉造假抄襲，雖已經有網友實測到英國倫敦政經學院圖書館經申請就能閱覽，總統府仍決定公開總統蔡英文36年前，透過打字機繕打好的400多頁論文原稿。
蔡英文也在昨（26日）晚透過臉書發文，並公布自己親筆簽下授權國家圖書館資料庫使用的授權書，蔡英文寫下長文「多年前作為一個博士研究生，我自然必須思考怎樣的研究，才能對這個世界有所貢獻。當時的世界經濟局勢，貿易保護主義再起，非關稅的貿易障礙衝擊國際經貿秩序；而台灣以外貿為發展重心，這個議題和我的國家息息相關。所以『Unfair Trade Practices and Safeguard Actions（不公平貿易與防衛機制）』，就成為我的博士論文題目。」
蔡英文表示，「不過，當時的我，做夢都沒有想到，有一天我會成為總統。我更沒想到，當年在倫敦用打字機一字一字、一頁一頁敲出來的博士論文，會在現在成為焦點，甚至成為特定人士抹黑的標的，成為不斷騷擾我的母校的理由。裝睡的人是叫不醒的，惡意的人也不會理會你的解釋。我的博士學位來自於倫敦政經學院（LSE）的認定，我的論文也已經在當年就交付學校，這些都有紀錄可查。甚至，現在LSE的官網上，都還有白紙黑字的紀錄，證實我的博士學位。」
蔡英文說，自己不怕抹黑，也不怕被檢驗，並在文末對所有埋頭寫論文的研究生們喊話「學術研究是一條寂寞的路，辛苦挫折一定會有，但這一切不是為了別人，是為了你自己。只要願意付出，你的努力絕不會被抹煞。而且，至少你們現在不必再用打字機寫論文了。」 讓台灣研究生直呼「最後一段感受很深」「寫過論文的人，對於妳這段時間的委屈，感同身受。每次寫完論文，我都不太願意再看，因為每次回顧都覺得自己這裏那裏寫得不夠好。」
國家圖書館也宣布，國圖獲蔡總統贈送博士論文電子檔，在國圖作業完畢，蔡總統除了授權民眾可以在線上檢索、瀏覽之外，也授權可以下載及列印，民眾自即日（27日）起即可在國圖的「臺灣博碩士論文知識加值系統」(https://ndltd.ncl.edu.tw)查閱。
