2017年,環保署推動「宮廟減香」政策宣導,卻演變成一場宮廟串聯反彈的政治風暴。當時,網路謠言散佈政府要「滅香封爐」,點燃宗教界怒火。有意角逐台南市長大位的立委陳亭妃,與她的政治盟友、台南市副議長郭信良遭點名,為搶宗教票,不惜拿此傷害小英;在蔡總統與環保署接連出面澄清「絕無滅香」之後,郭信良仍接受地方媒體採訪,聲稱政府實施《宗教法》《空汙法》,就是禁香、滅香,而且是「滅教」的政策,他將不惜拚命捍衛宗教自由。
另外,郭信良也曾涉及司法案件,2009檢方偵辦「台南市海佃國中新建校舍工程弊案」查出郭涉嫌在工程招標時,佯稱取得委員名單,收取建築師事務所酬金,又教唆教育處長王水文和海佃國中校長洪麗里變更招標方式,被起訴求刑7年;王、洪兩人則依違反貪汙治罪條例起訴。
2015年郭信良又涉「官田鋼鐵索賄案」,檢方指控,郭信良與助理郭仲進在2011年8月與官田鋼鐵榮譽董事長陳協同餐敘時,表示如果官田生產的廢渣給他處理,環評就能通過,陳男交付700萬前金後,環評案卻未過關,陳男於是終止支付尾款,台南地院認為,郭信良收取了700萬元,但他事後無法阻止群眾及議員的抗爭行動,不能因此認為他從一開始就存有詐騙犯意,獲判無罪。