因應包機回台，中央流行疫情指揮中心應變監測官莊人祥日前表示，將於北中南都準備隔離檢疫場所，但為避免造成附近居民恐慌或汙名化，確切地點暫時不公開。不料，柯文哲下午受訪時被問及指揮中心選定軍營作為安置場一說，柯文哲回答「你說用軍營？不是吧」，並爆料台北市分到的是在陽明山在台銀的宿舍，全台有五個（安置場所），原則上最標準是一人一間，所以軍營是通鋪也不適當。
對此，陳時中在中央流行疫情指揮中心傍晚的記者會上表示，任何人只要在未經過指揮中心的同意下發布相關訊息，都會有相關規定處置，至於會有什麼樣的處置，陳時中回應「看他講到什麼程度」。而柯文哲所言的地點是否為真，衛福部並無證實，僅表示，若是真的，就不排除評估換地方。
根據《聯合報》報導，柯文哲晚間再出席活動，被問及陳時中的說法，冷回「喔，那就不要講啊」。直到活動結束頻頻被問是否道歉？柯文哲才鬆口「我會檢討」，媒體追問，衛福部已說不排除開罰，柯文哲驚回「所以要被抓去關了是不是？」並發出呵呵笑聲，說他也在檢討。
