被爆出未依規定安排第一批武漢撤僑專機名單，沒讓老弱婦孺或傷病患者優先登機，台商徐正文被質疑優先讓自己親友返台，被外界砲轟將防疫資源當成自己的人情資本。對此，徐正文否認有圖利自己人的安排，更在鏡頭前哽咽淚喊「少點政治口水，多點人情味。」
而PTT網友也起底徐正文，身為鋼鐵韓粉的他，曾管理多個臉書韓粉社團，目前也擔任國民黨第20屆中央委員、黃復興黨部顧問以及大陸台商黨代表，也擔任北京市特邀政協委員、蘇州市特邀政協委員。遭批與國民黨、中共關係匪淺。
中國國民黨在本次武漢撤僑專機計畫中也參與協助，成立「7人小組」居中協調。對於徐正文引發的爭議，國民黨發布了新聞稿，強調因應武漢肺炎，防疫當前，國民黨的立場是「不分朝野、一起防疫」，徐正文的言行、主動發布第二次包機時間有誤，皆為徐的個人行為，與國民黨無關。
國民黨新聞稿中也呼籲，不希望有任何台商或是黨員發表意見對防疫造成影響，「請相關人士自我節制」。對於後續專機規劃則是尊重陸委會職權。最後更指出，若有黨員個人言行干擾防疫工作，將祭出黨紀處分。
