本刊調查，2003年SARS疫情爆發後，5月初立法院三讀通過《嚴重急性呼吸道症候群防治及紓困暫行條例》後，同月26日審議通過自2003年3月1日至2004年12月31日期間，花費500億元特別預算用在疫情防治及產業紓困等面向。
根據審計部決算資料顯示，當時特別預算使用範圍包括建立防疫預警體系、醫療通報制度、支付醫護人員津貼及獎勵金、徵用防疫設施等21項工作計畫，由15個主責部會執行，到2004年底卻只花費約230億元，整體執行率僅46％，主因為「疫情趨緩，相關支出未如預期」。
其中，當時特別預算分配到最多的是衛生署（尚未改制衛生福利部），預算數達236.5億餘元，佔整體預算4成以上，但最後僅執行133.1億餘元、保留2.6億餘元，執行率未達6成。審計部指出，衛生署執行預算剩餘超過100億元，主因是疫情趨緩，防護衣、口罩等醫療用品採購以及醫事人員、工作人員津貼的支出不如預期。
若比較各部會執行率，執行率最高的為新聞局的87.2％，但新聞局預算僅6,950萬元，用了6,060萬餘元。執行率最低的則是農委會的2.89％，農委會當時編列1億5千5百萬餘元的特別預算，卻僅花450萬餘元，連零頭都花不完。另一個執行率未達10％的部會是財政部，編列2,813萬元，僅花費157萬餘元，執行率僅5.61％。
對政院擬編列600億特別預算，國民黨團書記長蔣萬安表示，希望政院版能在國民黨版本基礎上，採納部分條文並回應當前民眾及產業需求。他也強調，未來國民黨團會在立法院好好把關，確保納稅人的錢每一分都能用在刀口上，協助受影響的產業及勞工度過這次疫情難關。
時代力量黨團總召邱顯智也表示，他更在意的是「錢有沒有花在刀口上，讓最需要的產業和勞工，能夠獲得相應的補助。」例如，抵用券真的能促進就業、振興產業，不能成為煙火式的振興政策。
