前總統馬英九對於蔡政府的防疫相關政策有過許多指教,例如是否該禁止口罩出口,或是武漢撤僑包機該如何處理,還表示「兩岸不存在國籍問題」,呼籲蔡政府在撤僑包機的決定上能退一步,讓滯留當地的國人和陸配子女能夠盡速回來,屢次引發各界爭議。
馬英九時期的2位衛生署長先後對這位昔日長官提出不同看法,葉金川曾在廣播節目中要馬「少說點話」,希望馬不要干擾到防疫工作;楊志良也說,他和葉金川的共識就是:「馬英九是好人,但不適合當總統。」
2位昔日部屬雖然說得委婉,但態度相當強硬,馬英九今日出席228紀念活動時被問及此事,他表示,葉金川是他擔任台北市長時的衛生局長,也是總統任內的衛生署長和府祕書長,2人交情將近50年,葉說不要干擾疫情沒有錯,「但關鍵問題,例如兒童的人權,該講的還是要講。」
至於楊志良稱他「不適合當總統」,馬冷回道:「他怎麼現在才知道呢?呵呵。」馬稱讚2位衛生署長都當得不錯,楊志良曾對二代健保和美牛問題都提出很好的建議,「但他們對我的發言有滿多的誤會,我並沒有去干擾指揮官指揮疫情。」他強調,在中國大陸許多陸配子女,有台灣居留權,也有中華民國的國籍,現在沒辦法回台灣,可是在台外僑,卻可以從中港澳回台,他認為相當不公平,有歧視之嫌,「身為前總統,該講的話還是要講。」