據了解，今年1月總統大選結束後，中研院就曾向陳建仁探詢卸任後是否願接受中研院邀請擔任特聘研究員。而熱愛學術研究的陳建仁，希望未來繼續投入流行病等公衛研究，因此決定接受邀請後，第一時間向蔡總統報告，透露將學術研究回饋於社會，是他最熱愛的畢生志業，「服務就是最大的權力」，認為還可以繼續在公衛領域讓為人類健康努力就是最大的幸福，不需要卸任後的禮遇。對此，蔡總統則向陳副總統表示，感謝與高度肯定。
事實上，陳建仁卸任後禮遇，除了邀請參加國家大典外，其他禮遇措施也將依法停止，包含每月18萬元禮遇，事務人員、司機、辦公室及各項事務等之費用、保健醫療、供應安全護等。
不過，針對陳建仁相關禮遇將依法停止，蔡總統考量副總統職務高度涉及國家機密後，特依「特種勤務條例」相關規定，核定陳建仁卸任副總統後仍屬於特勤維安的重要對象，持續提供一定程度的安全維護。此外，依法，陳建仁在副總統卸任禮遇的規範年限內，仍可選擇使用或不使用相關禮遇。
根據「卸任總統副總統禮遇條例」規定，卸任副總統享有禮遇如下
- 邀請參加國家大典。
- 按月致送新台幣18萬元禮遇金，並隨同公教人員待遇調整之。
- 提供處理事務人員、司機、辦公室及各項事務等之費用，第一年為新台幣400萬元，其後以每年50萬元逐年遞減。
- 供應保健醫療。
- 供應安全護衛4人至8人，必要時得加派之。
