上午8時57分,賴清德車隊抵達總統府,賴與妻子吳玫如下車後由新任總統府祕書長蘇嘉全迎接進入總統府,賴隨即在敞廳等待1分鐘後抵達的蔡英文車隊,當蔡進入府內,賴隨即跟在蔡身後步行進入就職儀式會場。
宣誓就職儀式唱國歌時,蔡英文、卸任副總統陳建仁都開口唱完,不過當畫面帶到賴清德時,他並沒有張嘴唱國歌,接著,眾人向國旗暨國父遺像三鞠躬。
許宗力監誓下,蔡英文高舉右手宣讀就職宣誓誓詞:「余謹以至誠,向全國人民宣誓,余必遵守憲法,盡忠職務,增進人民福利,保衛國家,無負國民付託。如違誓言,願受國家嚴厲之制裁。謹誓。」
賴清德接著上台,也高舉右手宣讀就職宣誓誓詞:「余謹以至誠,向全國人民宣誓。余必遵守憲法,效忠國家,如違誓言,願受國家嚴厲之制裁。謹誓。」
完成宣誓後,由立法院長游錫堃依《印信條例》規定將「中華民國之璽」及「榮典之璽」國璽以及總統印信授予蔡英文,並將副總統印信授予賴清德,完成相關程序後,府前鳴放21響禮炮。
總統就職儀式告一段落,進行行政院長蘇貞昌、總統府祕書長蘇嘉全、國安會祕書長顧立雄宣誓就職程序,並由蔡英文監誓,三人高舉右手宣讀誓詞:「余誓以至誠,恪遵國家法令,盡忠職守,報效國家,不妄費公帑,不濫用人員,不營私舞弊,不受授賄賂。如違誓言,願受最嚴厲之處罰,謹誓。」
就職儀式告一段落後,蔡英文、賴清德送陳建仁及其夫人羅鳳蘋離開總統府,而府內同仁也在敞廳鼓掌歡送陳建仁,陳建仁雙手合十向府內同仁致意後搭車離去。
上午10時蔡英文將前往台北賓館發表就職演說,這次總統副總統就職儀式因應防疫,不但室內座位安排都保持社交距離,且現場工作人員也都戴著口罩。