今年7月中旬振興三倍券上路前，蘇貞昌曾承諾將於台灣漫畫基地花費三倍券，購買台灣漫畫贈予孫女，13日在文化部長李永得等人陪同下，在漫畫基地選購了9本台灣原創漫畫及1張石虎明信片。挑選的漫畫有：《來自清水的孩子 2 》《送葬協奏曲》《雲之獸：來自遠古的守護者》《再見信天翁》《友繪的小梅屋記事簿》《閻鐵花》《海色北極星》《九天少年》《天橋上的魔術師》套書。
卻有網友從媒體拍攝的畫面中發現，在蘇貞昌結帳時竟出現行政院統編，國民黨新媒體部主任張智瑋在臉書質疑「是用納稅人錢發的三倍券買漫畫，然後再去行政院核銷嗎？」
對此行政院秘書長李孟諺13日晚間表示，「經查確有交際科同仁事先提供政院資訊給店家，從各家媒體新聞畫面中很清楚，店家在結帳時並沒有詢問蘇院長是否應該打上統編，蘇院長本人對於發票上資訊也不知情。為避免造成社會誤解，行政院已責成交際科同仁，明日立即向院長本人拿到發票後，前往更換收據發票。」也強調蘇貞昌公開使用三倍券購買漫畫贈給家人，於法不能用公款核銷，主計單位也不會核可。
台灣漫畫基地表示，蘇院長來漫畫基地結帳時，並沒有報統編，會在發票上打上統編，是政院科員於前置作業溝通時先行告知。並指出「打出去的發票如需更換，建議待週二書店開店時前來，我們會協助更換。」也請大家一起來支持台灣原創漫畫、多來漫畫基地消費。
