由民間團體發起的「珍愛藻礁」公投連署，要求經濟部重新選址，以保護需時千年才能形成的珍貴藻礁地形。根據「珍愛桃園藻礁」臉書指出，在新聞擴散之下，收到的連署書單日量續創新高，25日增加了2萬042份，總計14萬3,742份，不過距離成案門檻還缺20萬6,258份。
「珍愛桃園藻礁」指出，中選會告知二階連署書送件日最遲為3月17日（週三），而安全份數35萬份正本外加一份副本共70萬份，整理的工作龐大繁複，他們評估必須預留兩週彈性運作，否則最後湧入大量的連署書會因不及整理而無法送件，因此鼓勵大家2月28日前務必寄出，先消化可以整理的量，正式「寄件截止日」修正為3月10日（即收件截止日改為3月12日），盼在最後13天大家能再衝出一波連署。
此案雖由民間團體與學者發起，但日前因在野黨加入，使議題從環保變成了政治話題，模糊了焦點，過去支持核能的國民黨也表態支持保護藻礁，讓許多人認為，若支持保護藻礁是否等於支持核電政策與重啟核四，因此對於是否連署有了疑慮。
「搶救大潭藻礁行動聯盟召集人」潘忠政駁斥，自己從頭到尾反核、不可能支持核四重啟。環團人士也坦言，為了突破同溫層，不可能拒絕在野黨加入；律師蔡雅瀅則說，反核團體很多年前就出來支持保護藻礁，希望擁核人士不要消費此議題，更強調這次的問題在於選址，而非反對天然氣，希望在落實非核家園政策的同時也要兼顧環境保護。
政院：重新選址恐推遲完工 恐出現缺電危機
然而行政院發言人羅秉成表示，近日注意到許多愛護環境的年輕人在關注此議題，但他解釋，民進黨執政後已經將原本國民黨時期規劃興建的232公頃，縮減到只剩23公頃，蔡政府將開發面積大幅刪減到只剩1成，已經盡最大的力氣去保護、避開藻礁生態區域。
羅秉成也說，中油三接的興建過程曾評估其他方案，不過環團提出建議改興建在台北港的方案，預計要再拉40公里長的天然氣管線，還要重新環評，據經濟部評估，整體時程可能會推遲11年才完工，屆時核電廠除役，北部恐會出現電力缺口，因此行政院與經濟部支持中油在依照目前的規劃興建三接。
對於缺電的說法，蠻野心足生態協會專職律師蔡雅瀅不以為然，她指出，先前立法院公聽會上，台電總經理親口說三接會影響2.4%備用容量，後來經濟部又改口說影響6%，而事實上，大潭電廠也不是每天都在滿載發電，「為了開發，把需求講得很高」。
潘忠政也指出台電和經濟部說法不同，都是單方面說法，不如開聽證會來解決，但經濟部不敢，因此希望讓公投連署成案，這樣才有機會比對各種證據讓真相水落石出。
