由於國內疫情爆發，國產疫苗盼獲緊急使用授權，力拚在7月底供貨開打。陳佩琪醫師昨天於臉書談及此事，據說7月底有二期試驗的國產疫苗可以打，總統的國安團隊說總統要打這個，「除保護總統健康外， 還有宣揚台灣生技產業、做全民領頭羊的功能。」而總統要打什麼疫苗，有議員說是國安議題，「言下之意是總統可以選，醫護和平凡百姓沒得選，不過本來人命就有貴賤不同，議員都不能過問了，更不容許一般平民百姓說嘴」。
陳佩琪就不滿提到，上次她在臉書上問說「總統打了沒」，就被酸民罵到現在還不罷休，還被反嗆「總統要打國產疫苗， 妳不知道嗎？」她也藉此機會對國產疫苗提出疑問，「國產疫苗要到7月底（還是8月）耶？ 以台灣目前的狀況，可以等這麼久嗎？」
陳佩琪更補充反問，國產疫苗目前只有二期試驗的結果，「打了會有高效價的中和抗體，但這些抗體的efficiency（效能）呢？這些抗體真的會抗新冠病毒嗎？你給我打什麼病毒的spike protein（棘蛋白）抗原，只要我不是免疫不全，當然會產生大量的中和抗體，只是這些高titer（力價）的中和抗體， 真的能有效對付病毒嗎？」
陳佩琪分析，在未取得沒第三期實驗結果下，萬一是沒效抗體，「哪天真的病毒進來了，除無法殺死病毒外，抗體和抗原（病毒）結合成『抗原、抗體複合體』在人體內亂竄，大家有想過會引發什麼後果嗎？」面對現在社區疫情大爆發，此時再去申請三期試驗，她認為不僅緩不濟急，「人體試驗委員會大概也不會准了， 因為在疫情嚴峻之下，做這種雙盲實驗，大家會良心不安，可能害命，且極度不人道。」
最後，陳佩琪擔憂表示，若大規模打做到二期的疫苗，「台灣就變成一個最大的二期加三期的人體實驗場」，她更強調自己並非唱衰國產疫苗，「搞不好試驗下去會變成全球最有效的疫苗也說不定， 只是人命關天，建請執政高層慎之再慎之， 沒了健康， 股票漲再多也無福消受。」
