目前國內疫苗短缺，目前僅有透過全球疫苗分配平台COVAX取得的AZ疫苗，今（27日）再度配發41萬劑到各地單位，提供醫護和第一類人員施打，下個月預計還會有百萬劑莫德納（Moderna）疫苗抵台，但在疫情嚴峻的情況下，部分地方政府甚至喊話要自行採購中國疫苗，南投縣長林明溱就表示，已和上海代理商復星醫藥接洽，欲購30萬劑輝瑞疫苗。
台灣醫事行動聯盟指出，之前疫情指揮官陳時中已經有跟德國輝瑞原廠進行洽談購買。但除了價格問題外，輝瑞疫苗目前還有其他問題尚待解決。
首先是保存及運送分發的問題，輝瑞疫苗的mRNA疫苗需要以「-70°C」的極低溫保存運送，在解凍後，一般冰箱（2°C~8°C）可達之存放溫度只能放5天，為此輝瑞設計了一種特殊疫苗運輸盒；而莫德納疫苗僅需冷藏於低溫-25°C~-15°C即可，且解凍後可於一般冰箱存放30天。
其次為稀釋與施打的問題，輝瑞疫苗每罐在解凍後，需要以1.8mL 的0.9%生理食鹽水（NaCl）溶液稀釋，並只能提供5人施打（每人0.3ml）；莫德納解凍後則不須稀釋，每罐可供10人施打（每人0.5mL）。
至於為何「中國上海復星代理的德國輝瑞疫苗」並非台灣最好的選擇？台灣醫事行動聯盟直指原因在於疫苗試驗。德國原廠輝瑞疫苗分為BNT162b1跟BNT162b2，「只有BNT162b2通過德國全部的相關試驗」，而中國向德國採購的卻是BNT162b1，除了試驗未通過之外，在中國的施打率也非常低，「那到底台灣會購買到哪一種，又如何保證？」他們認為，台灣國產疫苗預計7月上市，為何要在此刻選擇較為不信任的代理來源。
台灣醫事行動聯盟還指出，美國輝瑞疫苗進口到亞太地區的香港、澳門的過程中，曾發生多次包裝不完整破損等問題，使得當地施打時程延宕，甚至是將不合格品施打在民眾身上的情況。
台灣醫事行動聯盟認為，台灣現階段最重要的問題應該放在「如何降載醫療量能」，大量接種疫苗無法立刻解決目前的疫情困境。他們擔心，國台辦準備要賣給台灣的上海復星代理疫苗效期只到6月底，若為配合即將到期的疫苗，短時間內要讓醫護施打完，接種後造成的身體不適恐怕會將目前緊繃的護理人力直接耗盡，這樣的做法形同讓台灣陷入另一個困境。
聯盟強調，疫苗在進口後為保障使用者的安全，食藥署會嚴格進行相關品管管制與臨床測試，莫德納疫苗測試標準品已抵台進行品管流程測試，最快6月將會抵台分送施打，而國產疫苗也持續由食藥署介入臨床研究與製程測試，預期7月會進行分送施打，「現在說要跟中國上海代理商進口實在是緩不濟急。」
