馬英九也因涉賤賣黨產遭起訴，台北地方法院日前開庭審結國民黨賤賣黨產案，前主席馬英九出庭時除了做無罪答辯，還2度批評檢察官非常規論告、起訴，說：「身為黨主席，依《廣電法》讓政黨退出媒體卻被控違法，難道人民守法錯了嗎？」但公訴檢察官認為馬犯後態度不佳，建請法院從重量刑。
國民黨於2005年12月宣布黨產三中交易已簽約，但依據台北地檢署查扣的國民黨內部會議錄音，2006年2月馬英九發現三中案的買方中時集團余建新資金不足，只想買中視，但國民黨早在前一年就宣稱國民黨退出媒體，三中黨產已賣給余建新，為避免交易生變而影響選情，開會時馬英九向負責黨產出售的張哲琛與汪海清表示，余建新因資金問題已到「生死攸關」，想利用買中視來轉型救中時，無意買中影及中廣，當時馬英九指示張哲琛等人再與余建新談，不要讓交易案破局。
當時與會的蔡正元還曾說，余建新就是吃定了你（馬英九）想選總統，錄音還錄到馬英九表示：「如果破局對我們比較好，那就破局，但如果真的到最後關頭，不能破局，你要思考，破局後怎麼對外說明，你已經對外講簽約了，這怎麼去對外說明，最後公布破局，我覺得公信力，會排山海，以後你講的話都沒有人會相信。」
當時馬英九與張哲琛等人開完會後，同意張哲琛等人提出名為「天龍八部」交易方式，以複雜的分潤、找補等流程，以出售為名先將三中賣給余建新，再由國民黨的中投公司將中影及中廣買回來，再找買家入主中影及中廣，達成讓余建新只想買中視的目的又不會導致產黨交易案破局，後來余建新辦公司主任還對馬英九說：「我們中國時報集團買三中，因為我們的本意，就是所的為黨解套。」這段錄音也已被檢察官查扣。
國民黨於2006年4月正式將中視、中廣及中影等3家公司賣給余建新手後，隨即由中投公司以買賣名義重新拿回中影與中視的控制權，隨後立即再找新買家接手，當時擔任立委的蔡正元找來了郭台強與莊婉均買中影，但郭台強2006年4月到中投公司後卻不願意簽約，最後由他的妻子羅玉珍及莊婉均當買家，與中投簽約買下中影。
市值百億的黨產中影公司交易案，歷經10餘年卻風波不斷，2006年參與交易的莊婉均及蔡正元均擔任過中影公司董事長，莊女還因掏空中影7.5億萬元遭判刑而入獄，蔡正元則因侵占中影3億元減資款曾遭收押，中影現任董事長為郭台強，但他不並是這件求償案的被告，因當年郭台強是由妻子出名與莊婉均向國民黨買下中影，並由蔡正元連帶保證，所以郭台強並未遭求償，目前是中影公司董事長。
