《月亮 樹》最初的拍攝動機，是楊貴媚以桂田文化藝術基金會執行長的身份，邀請蔡明亮拍片，希望能紀錄下資深藝人的身影。蔡明亮導演表示，每每看到資深藝人出現，就彷彿看到自己的家人一樣親切，自己從小都看這些人長大，也正是因為這份熟悉感，讓他認為要拍攝這些資深藝人的生活樣貌也是相當不容易的，畢竟要呈現他們在褪去舞台光環後、回到生活本身的原貌。
蔡明亮之所以會想拍攝以〈我愛月亮〉走紅的歌手李珮菁，因為42多年前，從大馬來台灣念大學時，李珮菁就很紅，蔡明亮還誇獎「她是第一代的作怪歌手！」隨後就提議李珮菁不如當場就唱一段〈玲瓏塔〉。李珮菁的歌聲依舊、歌詞也沒忘記，蔡明亮在一旁也跟著唱，證明了是真正的粉絲。
《月亮 樹》紀錄了李珮菁的日常生活，蔡明亮說其實可以把藝人的生活拍成紀錄片，圍繞著李珮菁的復健過程，但他並沒有選擇這樣，而是把自己的電影當成藝人的肖像畫。李珮菁也提到復健至今，其實現在她的腿可以踢出去，只是沒辦法靠自己縮回來，必須麻煩外傭代勞。楊貴媚稱讚她每天做運動，沒有放棄希望，「難不倒妳，只要相信自己！」李珮菁透露幾年前住院27天，理由是大腸壞死，醫生都宣佈她只剩下2天的壽命，但再去做檢查時，又發現那些腫脹消失了，「我沒有死，不然就是享年48歲。」
近年蔡明亮也有健康上的問題，自己的身體也在抗議，「想也知道，工作太多、壓力太大！」真的也沒有什麼辦法，慢慢調養，持續看醫生，聽醫生的話，因此也說未來的拍片風格，都跟自己的健康息息相關，「我將來的作品會更自由，因為我要那份自由。」
影片的另外一位主角常楓，蔡明亮說：「常爸是眾所皆知的老戲骨，不但活到老演到老，前年還在上海電影節拿到影帝。」這次在片中僅拍攝常楓走路的模樣，看似簡單其實也花了不少力氣，因為他的電影每顆鏡頭都拍攝很久，對常楓來說相當費力。常楓其實也知道他的拍攝風格，也願意在拍攝過程中盡力配合，自己常常拍到常楓也走到累了才喊停，敬業演出讓蔡明亮相當佩服。
